这是一篇震撼人心的小说。它像一根玫瑰的刺，刺破了我们在儿童文学的阅读中常见的温情之网，直逼人性的幽微深处。题目《爸爸的眼睛》，具有多重含义，既指代孟启元爸爸的眼睛；也指孟启元作为爸爸，预备移植给儿子的眼睛；最重要的，则是孟启元给予孟渊的机械眼。
　　人的内心是一个深渊。这句话尤其适用于小说中的孟启元。
　　细读文本，孟启元并不是单纯的“自私的知识分子父亲形象”。他经历了微妙的身份转变：一开始他是个儿子，为了自己的父亲，立志把自己的一生献给电子眼的研究。
　　然后，他成了父亲。初为人父的他并不是个好父亲，甚至是残酷的，他忽视了儿子作为独立的生命个体的诉求。也许我们可以这样来理解孟启元摘掉儿子眼球，换上机械眼的惊人之举。儒家传统中“父为子纲”，一向重父轻子，而且“身体发肤，受之父母”。孟启元深受儒家思想和中国宗法传统的影响，在他的内心，他想当然地把儿子当作了个人财产，认为自己拥有对儿子身体的全部掌控权和支配权。
　　作为科学家，他又有热烈的理想和世俗名利的渴望。一开始，和大多数心怀理想的年轻人一样，我们相信他的理想是纯粹而真诚的。他遭遇事业转折点所面临的困境，也是我们常人能够理解的。一个籍籍无名的年轻科研工作者，想要顺利开展项目，难度确实很大。在这个事业的节点，他做了一个惊人的举动：把儿子作为实验对象。这有悖常理，但是却凸显了孟启元想要成功的极度渴望。这渴望以牺牲儿子的正常双眼为代价。这时候，已经不单单是简单的理想旗帜在引导他，同时也有名利心在隐隐作祟。
　　一个孟启元，却可以用三句话评价他：他是孝顺的儿子，残酷的父亲，也是在理想与名利之间挣扎的科学家。
　　这篇小说中的代际关系很有深意。孟启元的爸爸和儿子都是才华横溢的画家，其中有着一种暗合，是命运的巧合，还是强大的遗传基因的作用？孟爷爷的双目失明，没有完成理想。戴着机械眼的孟渊的艺术生涯却登上了顶峰。成功没有给孟渊带来快乐。即使事业成功了，但孟渊骨子里还是个受害者，而且是肉体和情感的双重伤害。其中情感的伤害更重。孟渊真正的痛苦在于，机械眼把他从人类的温情中推开。而他是多么渴望这种温情。
　　把科幻小说写得如此流畅深情，没有丝毫生硬，这是赵海虹的独特之处。然而，她也不缺乏深度和开阔的视野。她的着眼点并不仅仅停留在一个家庭的痛苦纠葛，她并不仅仅打造一个煽情的故事，让人虐心。她要比这大气得多。
　　科学与人伦的矛盾冲突在孟启元身上集中体现出来了。他是现代人类的一个缩影，他面临的冲突，也是我们所面临的冲突。科技的武装，确实让我们变得越来越强悍。但为了发展，我们到底牺牲掉了什么？
　　墨西哥画家奥罗斯柯有一幅画《现代世界的众神》，其中似乎隐喻着：科学知识是现代世界的众神。可是，科学知识也把人类带向了毁灭。
　　也许奥罗斯柯作为画家的阴郁和绝望过于极端，赵海虹作为作家的隐隐担忧和疑问显得婉约和犹疑。但是，他们指向的，却是同一个问题。科学从来是一把双刃剑，开辟了通向未来的荆棘路，也在不同程度地给人类带来了伤害，无论是情感还是肉身的伤害。
　　在这篇小说里，赵海虹在结尾选择的是和解。她在结尾处所展现的乐观和温情，使得这篇小说也适合给孩子看。