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针对以最小化加权拖期和为优化目标的Job Shop调度问题，提出了一种基于瓶颈工件识别的免疫模拟退火算法。为描述各工件对最终调度性能影响的关键程度，定义了工件瓶颈特征量并提出基于人工调度经验的模糊推理系统以计算该特征量值。根据瓶颈工件需优先调度这一思路设计了一种有效利用工件瓶颈特征信息的免疫机制。在模拟退火过程中引入该免疫算法，并进行了大量数值计算实验。对不同规模问题的计算实例表明，该算法能够加快优化过程的收敛速度，取得较好的优化结果。