中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析

来源 :四川大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yu8886882

【摘要】

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基于前期已获得的中华蜜蜂（简称中蜂）幼虫肠道转录组数据,利用Top Hat2软件在正常（AcCK）及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品（AcT1、AcT2、AcT3）中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可

【作者】

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郭睿李龙熊翠玲郑燕珍付中民王海朋赵红霞陈大福

【机构】

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福建农林大学蜂学学院,广东省生物资源应用研究所

【出处】

：

四川大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2018年6期

【关键词】

：

中华蜜蜂幼虫肠道球囊菌胁迫可变剪切 ASs cerana cerana Larval gut Ascosphaera apis Stress Alter

【基金项目】

：

国家自然科学基金（31702190）, 现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-44-KXJ7）, 福建省教育厅中青年教师教育科研项目（JAT170158）, 福建农林大学科技创新专项基金项目（CXZX2017343）

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基于前期已获得的中华蜜蜂（简称中蜂）幼虫肠道转录组数据,利用Top Hat2软件在正常（AcCK）及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品（AcT1、AcT2、AcT3）中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可变剪切事件,其中以基因间（17.68%）、可变3＇端剪切（15.32%）、外显子跨越（14.12%）和可变5＇端剪切（12.81%）类型为主.Venn分析结果显示4个肠道样品的共有可变剪切基因数为8111个,特有可变剪切基因数分别为272、189和385个.GO分类结果显示共有可变剪切基因涉及47个条目

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