【摘 要】
:
目的 应用综合生物信息学来识别瘦素调控小鼠胆囊收缩与分泌的关键致病基因并揭示潜在的分子机制.方法 GSE3293的表达谱从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载,该数据包
【机 构】
:
内蒙古医科大学研究生学院,呼和浩特,010059内蒙古自治区人民医院肝胆胰脾外科,呼和浩特,010017;内蒙古自治区人民医院临床医学研究中心,呼和浩特,010017;山西省忻州现代医院普外科 034
论文部分内容阅读
目的 应用综合生物信息学来识别瘦素调控小鼠胆囊收缩与分泌的关键致病基因并揭示潜在的分子机制.方法 GSE3293的表达谱从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载,该数据包含8个样品,包括4个瘦素干预小鼠胆囊样品和4个0.9%氯化钠溶液干预小鼠胆囊样品.通过GEO在线GEO2R-TOP250软件或工具分组分析,获得最有价值的250个差异表达基因(DEGs),并通过生物信息学方法对其进行深入分析.通过DAVID在线软件对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都百科全书基因和基因组(KEGG)通路富集分析.由STRING数据库构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.结果 从GSE3293数据集中共鉴定出DEGs 250个,其中197个基因被上调,53个基因被下调.GO分析表明,DEGs的生物学功能主要集中在MHCⅡ类蛋白复合物上、质膜与细胞外区反应.KEGG通路分析显示这些DEGs主要参与肺结核、利什曼病、细胞黏附分子、噬菌体、感染等信号通路.PPI网络显示这些DEGs编码的蛋白质相互作用较强,并筛选出前5对相关性最强的DEGs.结论 利用生物信息学技术对小鼠胆囊DEGs的功能富集及PPI分析,从基因层面预测了胆石症发生的分子机制,但其DEGs的功能尚需要大量临床试验及分子生物学实验来证实.
其他文献
目的 探讨高龄急性化脓性胆囊炎患者经皮经肝胆囊穿刺置管引流术后手术时机的选择.方法 回顾性分析2018年1月-2019年2月中国人民解放军联勤保障部队第九○○医院肝胆外科56例
当下国家教育教学改革和人才个性化培养中,体音美等艺体类课程得到了加强,尤其是为了提高学生的身体素质,教育部从2016年开始就以规范的教育文件要求中小学要开满、开足体育
目的探讨深圳地区汉族人群人类主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因(MIC)B等位基因多态性及分布特征。方法选择2012年8月至2014年12月,于广东省深圳市血液中心献血的202例无血缘关系的深圳地区汉族健康献血者为研究对象。根据自行设计的MICB基因聚合酶链反应(PCR)扩增引物及测序引物,采用PCR -直接测序(SBT)法对献血者MICB基因第2~4外显子进行序列测定,并采用统计学方法对本组深圳
肝细胞移植治疗多种原因造成的肝功能衰竭,在临床上已取得较好的疗效.诱导多功能干细胞(iPS)及其定向分化技术的进步,为获得大量、安全及具有生物学功能活性的肝细胞移植所需的种子细胞提供了一种新的方法.对iPS定向分化成肝细胞并应用于肝细胞移植治疗肝功能衰竭的研究进展进行综述。
在小学教学中,阅读教学是非常重要的组成部分,阅读主要是将书本的文字信息转换成形象且可感的画面,对小学生的想象能力以及语言表达能力有着重要的意义.合理凸显“画面感”对
目的 探讨住院医师规范化培训模式下外科专业型硕士研究生科研能力现状,并探讨切实可行的对策.方法 选择2015年9月-2017年12月在首都医科大学附属北京友谊医院住院医师规范化
糖尿病胃轻瘫(diabetic gastroparesis,DGP)的组织学改变包括Cajal间质细胞(Cajal interstitial cells,ICC)的神经元、平滑肌细胞以及间质细胞的损伤等.DGP病程发展过程中胃
淋巴瘤是淋巴造血系统常见恶性肿瘤之一,非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL)是其主要类型(约占80%).NHL是一组在临床表现、分子发病机制及治疗反应等方面均存在高度异
目的探讨抗氧化剂虾青素(ASTA)对储存早期去白细胞悬浮红细胞超微结构,氧化应激水平,包括活性氧族(ROS)与丙二醛(MDA)含量,以及2,3-二磷酸甘油酸(DPG)含量的影响。方法自2013年5~6月于河北省血液中心制备的去白细胞悬浮红细胞制剂中,采用简单随机抽样方法抽取6份去白细胞悬浮红细胞制剂标本为研究对象。将每份去白细胞悬浮红细胞制剂平均分装至4个空血袋内,按照随机数字表法随机选择其中1袋
肌骨模型是基于生理学、工程分析和计算机三维图像技术的用于分析人体运动系统中肌肉与骨骼之间相对位置关系的几何模型,是分析人体生物力学特性的基础,由于其在研究人体肌肉骨骼系统生物力学上的优越性而越来越多地被应用.就肌骨模型在膝关节生物力学研究中的应用进展作一综述。