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肠道菌群在机体营养物质吸收、代谢和免疫防御等方面起着关键作用，被认为是维持人类宿主健康的基石。肝脏中合成的胆汁酸进入肠道后不仅能促进脂溶性物质的吸收，直接或间接地影响肠道菌群的结构和功能，又可在肠道菌群的作用下转变成次级胆汁酸，并通过肠肝循环被重吸收回肝脏。肠道菌群和胆汁酸之间复杂的对话机制参与炎症性肠病（IBD）等肠道炎症的发生发展。本文就肠道菌群、胆汁酸及其交互作用对IBD的影响和治疗应用的进展进行综述。