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20世纪70年代以前，我国西瓜生产用种均是固定品种，由瓜农自行留种，没有专业制种。随着杂交一代西瓜品种的推广，西瓜专业制种开始启动，到80年代末全国西瓜生产用种全部实现了杂种一代化。
1 制种田的选择和隔离
选择多年未种过葫芦科、茄科、烟草等作物的田区，前茬以小麦、玉米、苜蓿茬最好，选择大豆茬种植西瓜，一定要查明3年内是否用过普施特、豆磺隆等高残毒除草剂，以免发生药害。西瓜是喜温作物，耐旱怕涝，好气性强。适宜在土层深厚，土质疏松肥沃、有机质含量高、pH值呈中性、排水条件好且5年内未种过西瓜的沙壤土中种植，切忌重茬连作。为保证种子纯度，制种田应与瓜类作物田相隔1000m以上。
2 亲本种子的准备
西瓜杂交制种亲本种子必须是具备原品种特征特性、纯度不低于99.7％、发芽率不低于90％的国标一级的亲本种子。亲本种子分父、母本种子、父、母本种子又分大粒、中粒、小粒。一般母本大粒种子直播667 m2用量0.3～0.35 kg，中粒种子0.2～0.25 kg，小粒种子0.1～0.15 kg。父本种子一般667m2用量20g左右。父、母本配比为1:10～15。
3 精细整地，多施基肥，早覆地膜
3.1 深耕冻垡，耕耙保墒
制种田一般于头年秋季深翻，通过深耕冻垡改善土壤结构。来年早春于4月中旬前整地施肥，每667m2施优质农家肥3000～5000 kg、复合肥20 kg、磷肥50～60 kg，深翻，拍碎土块，耙平地面，做畦。畦宽1.5m左右，沟宽0.4m。整地、施肥及覆膜要在播种前10～15 d完成，以提高地温利于出苗，
3.2 适时播种
西瓜适于直播。以当地5cm地温稳定在15℃以上、过晚霜期为最佳播种期的依据，依地区不同一般在4月下旬至5月上旬播种。父本比母本提早7～10d(天)播种，这样既保证了父、母本花期相遇，也可对父本进行花期纯度鉴定，父本播种集中在母本田边，与母本种植区要明显区别，株距45cm以上。母本播种株距依品种而定。大果形品种适当稀播，小果形品种适当密播。早熟品种株距15～20cm，667m2保证成苗2700株；中晚熟品种株距20cm，667m2保证成苗2000株。父、母本按1:10～15配备。每穴播1～2粒，深1.5～2cm，同时在播种穴内放人少量杀地下害虫药剂，要使种子与湿土充分接触，播种穴口上覆盖细碎干土，播种结束需及时覆盖地膜(也可先盖地膜后播种)。
4 栽培管理
4.1 定苗、整枝
西瓜直播后7～10 d即可出苗。当瓜苗3～4片真叶时定苗，选优去劣，每穴留1株，遇缺苗旁边的穴留双苗。瓜苗伸蔓时父本每株留4～5条蔓，其余侧枝全部去除，同时保留枝蔓上的全部雄花，便于釆花授粉；也有些地区对父本不整枝，而是采取保留全部枝蔓任其生长的方式，母本每株留1条主蔓，其余侧枝全部去除，同时将枝蔓上的雄花全部抹除干净，只留雌花杂交授粉，当母本雌花授粉后果实鸡蛋大小时，停止整枝。整枝应在晴天进行，阴雨天操作易使植株伤口侵染病菌，传播病毒。
4.2 水肥
底墒充足，苗期一般不浇水，在第1朵雌花开放前轻浇1次水，促进茎叶生长。初花期和坐果期要控制灌水，防止植株徒长引起化瓜。杂交授粉结束多数西瓜鸡蛋大小时，浇1次大水，但切忌漫灌，防止烂瓜，结合浇水，在瓜垄另一侧距根部30 cm，处沟施15～20kg复合肥，促进膨果。结果期应增施磷、钾肥，以利提高产品质量，
4.3 去杂
定植前、授粉前、采收前和采种时必须根据亲本植株、叶片、果实和种子特征特性，进行严格的去杂去劣，把不符合亲本特性的植株和种子全部去除，
4.4 病虫害防治
制种田病虫害的防治和商品瓜栽培防治措施相同。
5 杂交授粉
人工授粉是西瓜杂交制种成败的关键。父本去杂、母本去雄、雌花套袋多重保纯措施，是提高种子杂交率的重要手段。
5.1 父本去杂
杂交授粉前，根据叶形、叶色、瓜蔓、绒毛，特别是在父本植株开花期间已结小瓜的时候可根据果实的形状、色泽、花纹等特征将株型不一、叶形不一、子房形态不一等不符合父本标准性状及不确定的可疑植株全部拔除，宁错勿漏，确保父本植株纯正，方可进行杂交授粉。
5.2 母本去雄
结合整枝，摘除母本行中的全部雄性花蕾。在确定好授粉期后，应提前1～2d将母本已开的雌花、雄花(包括后面要开的花)进行1次彻底清理。在授粉期的每天下午和早晨，于授粉前逐株、逐蔓、逐节检查，彻底清除漏摘的雄花。反复检查以确保授粉当天没有开放的雄花。
5.3 套帽隔离
授粉前1 d下午在制种区寻找母本，凡是雌花花冠显绿黄色且呈膨松状的雌蕾即是第2天要开放的雌花，用自制的红纸帽将其套严，便于第2天授粉。对第2天要开放的父本雄花也要用红纸帽套住。纸帽要套牢，防止风吹掉。
5.4 花粉采集，授粉，作标记
每天清晨6:00开花之前，采摘父本雄花放在带盖的容器内，置阴凉处，授粉时随用随取。切忌采摘前1d开过的雄花。杂交西瓜授粉雌花的节位，以第2、3朵雌花为宜。坐果节位低，果实产籽量低；节位适中，果实产籽量高。对节位低的雌花不要授粉。
授粉时，在母本田区找到前1 d套帽的母本雌花，脱去红纸帽，将采摘好的父本雄花花辦翻转露出雄蕊，在母本雌花的柱头上轻轻触抹(切忌用力涂抹)，将花粉均匀抹满柱头。这对提高受精率，防止出现“歪把子”瓜，促进果实生长和提高种子数都有很好的作用。正常情况下，一般每朵雄花可授2～3朵雌花。授粉后，将雌花用白纸帽罩上，同时在授粉雌花果柄部或在雌花紧邻的节间上用线绳、标记环或者铁丝等作授粉后的标记，以确保是杂交授粉的果实。授粉时注意要将母本雌花中的两性花、植株去雄不完全的雌花或前1 d未套帽的雌花去除，不能杂交授粉。杂交授粉的西瓜子房在3～4 d后迅速膨大，长至鸡蛋大小时，表明该株已坐住果，可停止该株授粉。一般每株母本坐1个授粉果，同时将未授粉的果实摘除。当杂交西瓜制种田母本授粉结束后，立即将整个田区的父本全部铲除干净，严禁父本植株坐果留种，确保育种者的合法权益。
5.5 打顶
制种瓜须打顶，使养分集中供应种瓜；以利于种瓜发育。坐瓜后早熟品种蔓长1.3 m、中晚熟品种1.5 m时即可打顶。
5.6 对杂交授粉果实作第2次标记
当授粉果实生长发育至碗口大小时翻瓜，同时认真检查果实是否全部杂交授粉，对果实上有授粉标记的，用油漆或记号笔在杂交果实上作第2次标记，再次确认是否为人工杂交授粉的果实。对没有标记或标记不清楚的果实连同瓜秧一起拔除，确保田区内无一“自由果”。
6 采种
在授粉后35～40 d，果实充分成熟，果实内的种子达到形态和生理完全成熟时采收果实。这样有利于增加种子千粒重，提高种子发芽率。采收前进行第3次检查，将投有标记或标记不清的果实、畸形果、烂果、落果及异形、异色(果皮)杂果等一并去除。对做过2次标记并完全符合母本特征特性的杂交果实统一采收、堆放、后熟。破果取种时进行最后1次把关，去掉果肉颜色、种子大小、色泽花纹不一致的果实。最后将果实和种子性状完全一致的杂交果实果肉连同种子一起掏人缸中或编织袋里(杜绝铁器)，16～18 h(小时)果肉发酵后，取出洗净、晾干，除去秕粒和杂质，装袋保存。同时将每个包装袋内外均放置标牌，写明袋号、户名、品种名称、数量、年份，以待交售。种子应置于低温和通风条件下，切勿放置在潮湿环境中，以免种子吸潮变质。
7 种子检验
瓜类种子检验依照GB 16715.1-1996标准执行，进行田间鉴定和室内鉴定。在田间主要进行纯度鉴定。瓜类田间纯度鉴定又分为叶形叶色鉴定、子房鉴定和成瓜鉴定等，室内鉴定主要是种子发芽率、含水量和净度检验，西瓜种子国标规定：一级杂交种纯度不低于98％，二级杂交种纯度不低于95％，发芽率不低于90％，水分不高于8％，净度不低于99％。杂交西瓜种子经过鉴定检验，达到国家规定的种子质量标准后方可分级包装，进入市场销售。
1 制种田的选择和隔离
选择多年未种过葫芦科、茄科、烟草等作物的田区，前茬以小麦、玉米、苜蓿茬最好，选择大豆茬种植西瓜，一定要查明3年内是否用过普施特、豆磺隆等高残毒除草剂，以免发生药害。西瓜是喜温作物，耐旱怕涝，好气性强。适宜在土层深厚，土质疏松肥沃、有机质含量高、pH值呈中性、排水条件好且5年内未种过西瓜的沙壤土中种植，切忌重茬连作。为保证种子纯度，制种田应与瓜类作物田相隔1000m以上。
2 亲本种子的准备
西瓜杂交制种亲本种子必须是具备原品种特征特性、纯度不低于99.7％、发芽率不低于90％的国标一级的亲本种子。亲本种子分父、母本种子、父、母本种子又分大粒、中粒、小粒。一般母本大粒种子直播667 m2用量0.3～0.35 kg，中粒种子0.2～0.25 kg，小粒种子0.1～0.15 kg。父本种子一般667m2用量20g左右。父、母本配比为1:10～15。
3 精细整地，多施基肥，早覆地膜
3.1 深耕冻垡，耕耙保墒
制种田一般于头年秋季深翻，通过深耕冻垡改善土壤结构。来年早春于4月中旬前整地施肥，每667m2施优质农家肥3000～5000 kg、复合肥20 kg、磷肥50～60 kg，深翻，拍碎土块，耙平地面，做畦。畦宽1.5m左右，沟宽0.4m。整地、施肥及覆膜要在播种前10～15 d完成，以提高地温利于出苗，
3.2 适时播种
西瓜适于直播。以当地5cm地温稳定在15℃以上、过晚霜期为最佳播种期的依据，依地区不同一般在4月下旬至5月上旬播种。父本比母本提早7～10d(天)播种，这样既保证了父、母本花期相遇，也可对父本进行花期纯度鉴定，父本播种集中在母本田边，与母本种植区要明显区别，株距45cm以上。母本播种株距依品种而定。大果形品种适当稀播，小果形品种适当密播。早熟品种株距15～20cm，667m2保证成苗2700株；中晚熟品种株距20cm，667m2保证成苗2000株。父、母本按1:10～15配备。每穴播1～2粒，深1.5～2cm，同时在播种穴内放人少量杀地下害虫药剂，要使种子与湿土充分接触，播种穴口上覆盖细碎干土，播种结束需及时覆盖地膜(也可先盖地膜后播种)。
4 栽培管理
4.1 定苗、整枝
西瓜直播后7～10 d即可出苗。当瓜苗3～4片真叶时定苗，选优去劣，每穴留1株，遇缺苗旁边的穴留双苗。瓜苗伸蔓时父本每株留4～5条蔓，其余侧枝全部去除，同时保留枝蔓上的全部雄花，便于釆花授粉；也有些地区对父本不整枝，而是采取保留全部枝蔓任其生长的方式，母本每株留1条主蔓，其余侧枝全部去除，同时将枝蔓上的雄花全部抹除干净，只留雌花杂交授粉，当母本雌花授粉后果实鸡蛋大小时，停止整枝。整枝应在晴天进行，阴雨天操作易使植株伤口侵染病菌，传播病毒。
4.2 水肥
底墒充足，苗期一般不浇水，在第1朵雌花开放前轻浇1次水，促进茎叶生长。初花期和坐果期要控制灌水，防止植株徒长引起化瓜。杂交授粉结束多数西瓜鸡蛋大小时，浇1次大水，但切忌漫灌，防止烂瓜，结合浇水，在瓜垄另一侧距根部30 cm，处沟施15～20kg复合肥，促进膨果。结果期应增施磷、钾肥，以利提高产品质量，
4.3 去杂
定植前、授粉前、采收前和采种时必须根据亲本植株、叶片、果实和种子特征特性，进行严格的去杂去劣，把不符合亲本特性的植株和种子全部去除，
4.4 病虫害防治
制种田病虫害的防治和商品瓜栽培防治措施相同。
5 杂交授粉
人工授粉是西瓜杂交制种成败的关键。父本去杂、母本去雄、雌花套袋多重保纯措施，是提高种子杂交率的重要手段。
5.1 父本去杂
杂交授粉前，根据叶形、叶色、瓜蔓、绒毛，特别是在父本植株开花期间已结小瓜的时候可根据果实的形状、色泽、花纹等特征将株型不一、叶形不一、子房形态不一等不符合父本标准性状及不确定的可疑植株全部拔除，宁错勿漏，确保父本植株纯正，方可进行杂交授粉。
5.2 母本去雄
结合整枝，摘除母本行中的全部雄性花蕾。在确定好授粉期后，应提前1～2d将母本已开的雌花、雄花(包括后面要开的花)进行1次彻底清理。在授粉期的每天下午和早晨，于授粉前逐株、逐蔓、逐节检查，彻底清除漏摘的雄花。反复检查以确保授粉当天没有开放的雄花。
5.3 套帽隔离
授粉前1 d下午在制种区寻找母本，凡是雌花花冠显绿黄色且呈膨松状的雌蕾即是第2天要开放的雌花，用自制的红纸帽将其套严，便于第2天授粉。对第2天要开放的父本雄花也要用红纸帽套住。纸帽要套牢，防止风吹掉。
5.4 花粉采集，授粉，作标记
每天清晨6:00开花之前，采摘父本雄花放在带盖的容器内，置阴凉处，授粉时随用随取。切忌采摘前1d开过的雄花。杂交西瓜授粉雌花的节位，以第2、3朵雌花为宜。坐果节位低，果实产籽量低；节位适中，果实产籽量高。对节位低的雌花不要授粉。
授粉时，在母本田区找到前1 d套帽的母本雌花，脱去红纸帽，将采摘好的父本雄花花辦翻转露出雄蕊，在母本雌花的柱头上轻轻触抹(切忌用力涂抹)，将花粉均匀抹满柱头。这对提高受精率，防止出现“歪把子”瓜，促进果实生长和提高种子数都有很好的作用。正常情况下，一般每朵雄花可授2～3朵雌花。授粉后，将雌花用白纸帽罩上，同时在授粉雌花果柄部或在雌花紧邻的节间上用线绳、标记环或者铁丝等作授粉后的标记，以确保是杂交授粉的果实。授粉时注意要将母本雌花中的两性花、植株去雄不完全的雌花或前1 d未套帽的雌花去除，不能杂交授粉。杂交授粉的西瓜子房在3～4 d后迅速膨大，长至鸡蛋大小时，表明该株已坐住果，可停止该株授粉。一般每株母本坐1个授粉果，同时将未授粉的果实摘除。当杂交西瓜制种田母本授粉结束后，立即将整个田区的父本全部铲除干净，严禁父本植株坐果留种，确保育种者的合法权益。
5.5 打顶
制种瓜须打顶，使养分集中供应种瓜；以利于种瓜发育。坐瓜后早熟品种蔓长1.3 m、中晚熟品种1.5 m时即可打顶。
5.6 对杂交授粉果实作第2次标记
当授粉果实生长发育至碗口大小时翻瓜，同时认真检查果实是否全部杂交授粉，对果实上有授粉标记的，用油漆或记号笔在杂交果实上作第2次标记，再次确认是否为人工杂交授粉的果实。对没有标记或标记不清楚的果实连同瓜秧一起拔除，确保田区内无一“自由果”。
6 采种
在授粉后35～40 d，果实充分成熟，果实内的种子达到形态和生理完全成熟时采收果实。这样有利于增加种子千粒重，提高种子发芽率。采收前进行第3次检查，将投有标记或标记不清的果实、畸形果、烂果、落果及异形、异色(果皮)杂果等一并去除。对做过2次标记并完全符合母本特征特性的杂交果实统一采收、堆放、后熟。破果取种时进行最后1次把关，去掉果肉颜色、种子大小、色泽花纹不一致的果实。最后将果实和种子性状完全一致的杂交果实果肉连同种子一起掏人缸中或编织袋里(杜绝铁器)，16～18 h(小时)果肉发酵后，取出洗净、晾干，除去秕粒和杂质，装袋保存。同时将每个包装袋内外均放置标牌，写明袋号、户名、品种名称、数量、年份，以待交售。种子应置于低温和通风条件下，切勿放置在潮湿环境中，以免种子吸潮变质。
7 种子检验
瓜类种子检验依照GB 16715.1-1996标准执行，进行田间鉴定和室内鉴定。在田间主要进行纯度鉴定。瓜类田间纯度鉴定又分为叶形叶色鉴定、子房鉴定和成瓜鉴定等，室内鉴定主要是种子发芽率、含水量和净度检验，西瓜种子国标规定：一级杂交种纯度不低于98％，二级杂交种纯度不低于95％，发芽率不低于90％，水分不高于8％，净度不低于99％。杂交西瓜种子经过鉴定检验，达到国家规定的种子质量标准后方可分级包装，进入市场销售。