由于未采用最佳治疗方案或者病人未能坚持高效抗逆转录病毒疗法(HAART),导致人体免疫缺损病毒-Ⅰ(HIV-1)耐药的出现。然而,即使患者能够很好地坚持HAART治疗,也很难长期维持检测水平以下的病毒载量。通常来说,单个HIV-Ⅰ靶基因的变异,即可特异性导致病毒对相应抗逆转录病毒药物的耐药。但是,应用3种药物联合治疗时,病毒至少需要有针对3种抗逆转录病毒药物的变异才会引起耐药和治疗失败。这些耐药突变的出现常为暂时性的,并与药物的半衰期(t1/2)和耐药株的病毒活力有关。特异性的耐药突变在主要的药物种类中,即核苷类似物逆转录酶抑制剂(NRTI,如nevi-rapine)、非核苷类似物逆转录酶抑制剂(NNRTI,如AZT)、蛋白酶抑制剂(PI,如nelfinavir)和整合酶抑制剂(INI,如raltegra-vir),已广为人知。然而,由于HIV-1的基因背景及二次变异的差异,病毒的耐药水平可能高低不一。另外,特异性的抗逆转录病毒药物CCR5拮抗剂(如maraviroc)可通过多种未知机制及途径选择耐药突变。基于在乌干达、中国、阿根廷和其他一些国家的研究,本研究所研发了1种检测耐药的新技术。该技术不仅可检测B亚型(主要流行于欧洲和北美),还可检测其他不同亚型HIV中新出现的耐药。为更好了解表型耐药情况,还研发了1种新的应用PCR技术从患者体内快速扩增HIV靶基因,利用酵母重组技术克隆其进入HIV基因组中。然后用产生的嵌合病毒做药物敏感试验。较之细菌克隆技术、酵母重组技术允许克隆更大的HIV基因,且不需要特别的克隆位点。由于表型分析法更为常用且费用较高,也研发了1种基因型耐药分析法。该方法是在绝大多数耐药突变位点上应用特异性寡核苷酸连接法分辨出该突变位点的存在与否。耐药突变的频率由多功能流式荧光检测仪测定。