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为进行绵羊PRNP等位基因密码子136、154、171的多态性研究,建立适合于绵羊PRNP等位基因开放阅读框(ORF)内高变区PCR—SSCP分析方法,对凝胶浓度、交联度、甘油浓度、电泳电压、电泳时间、PCR产物与变性缓冲液比例、电泳缓冲液浓度、上样量等影响因素进行了优化试验。在优化中引入了正交试验法,以使优化过程简化,结果可靠。结果表明,交联度49:1、甘油浓度0%、凝胶浓度12%、电泳电压200V、PCR产物上样量≥2.0μL且〈4.0μL、PCR产物与变性缓冲液比例1:4、0.5×TBE缓