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高水平学科建设是医院提高核心竞争力,实现可持续发展的重要抓手。大学附属医院在学科建设上有优势,也面临诸多困境。开展临床医学学科与大学基础学科共建,促进临床与基础深度融合,提升医院综合科技创新能力是一种有益的探索。文章以广州医科大学附属第二医院与广州医科大学基础医学院学科共建取得初步成效的经验为例,探讨了大学附属医院临床医学学科与大学基础学科共建模式的实施措施和成效,为大学附属医院开展学科建设进行了有益的尝试。