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旨在了解番茄根内生芽孢杆菌（Bacillus spp.）的分布和物种多样性。采用纯培养的方法从11种不同的番茄栽培品种中分离纯化根内生芽孢杆菌,并通过16S r RNA基因序列的扩增、测序和分析进行分子鉴定及系统发育分析。从11个样品中分离出芽孢杆菌65株,分别鉴定为芽孢杆菌属（Bacillus）和短芽孢杆菌属（Brevibacterium）的18个种。不同的番茄栽培品种分离的根内生芽孢杆菌的种类存在差异。系统发育分析表明分离的内生芽孢杆菌聚为几个小簇和不同种群,但是来源于不同番茄品种的同一种属的芽孢杆菌