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2019年12月中旬以来，武汉出现了以发热、乏力、咳嗽、呼吸不畅为主要症状的不明原因肺炎病例，各级政府、卫生部门展开调查，迅速确定这类病例的病原为新型冠状病毒，世界卫生组织确认并命名为2019-nCoV，该病原感染所致的肺炎称为新型冠状病毒肺炎。为了加深对这一新型疾病的认识和理解，不妨追根溯源，了解一下传染病，以及以冠状病毒为主的重要传染病毒的源起。
传染病是由各種病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。
传染病的特点是有病原体，传染性和流行性，感染后常有免疫性。有些传染病还有季节性或地方性。
传染病的分类尚未统一，可以按病原体分类，也可以按传播途径分类。传染病的预防应采取以切断主要传播环节为主导的综合措施。传染病的传播和流行必须具备3个环节，即传染源（能排出病原体的人或动物）、传播途径（病原体传染他人的途径）及易感人群（对该种传染病无免疫力者）。若能完全切断其中的一个环节，即可防止该种传染病的发生和流行。各种传染病的薄弱环节各不相同。除主导环节外对其他环节也应采取措施，这样才能更好地预防各种传染病。
冠状病毒是一大类病毒，已知会引起疾病。患者表现从普通感冒到重症肺部感染不同，例如中东呼吸综合症（MERS）和严重急性呼吸综合症（SARS）。
人体内的冠状病毒最早于上世纪60年代在英国被分离出来，病毒因其表面皇冠状的突起物而得名。它可能与人、猪、猫、狗、鼠和鸡的呼吸系统感染相关。2003年中国出现的SARS病毒就属于冠状病毒。MERS为第六种已知的人类冠状病毒，也是过去10年里被分离出来的第三种。
此次引起流行的冠状病毒为一种变异的新型冠状病毒。由于冠状病毒发生抗原性变异产生了新型冠状病毒，人群缺少对变异病毒株的免疫力，所以可引起新型冠状病毒肺炎的流行。
我国第一株从环境样本中分离的新型冠状病毒电镜下照片。图/ 国家病原微生物资源库
冠状病毒大部分感染动物。很多野生动物都可能携带病原体，成为某些传染病的传播媒介。果子狸、蝙蝠、竹鼠、獾等是冠状病毒的常见宿主。
1月26日，中国疾控中心病毒病所在病毒溯源研究中取得阶段性进展。该所首次从武汉华南海鲜市场的585份环境样本中，检测到33份样品含有新型冠状病毒核酸，并成功在阳性环境标本中分离病毒，提示该病毒来源于华南海鲜市场销售的野生动物 。
2月9日，湖北省召开发布会，疫情防控科研攻关组专家陈焕春介绍了工作进展：“华南农业大学报道了穿山甲有可能是潜在的中间宿主，我们认为新型冠状病毒也可能存在多个中间宿主。该报道发现穿山甲毒株与目前感染人毒株序列相似度高达99%。这个相似性还在观察，它可能是某个基因片断，或整个全基因组序列。中国科学院武汉病毒所石正丽教授最近发现了新型冠状病毒与一种蝙蝠的全基因序列的同源性达到96%，如果（新型冠状病毒全基因序列）与穿山甲相似性高达99%，参考价值就更大了。当今人类新发传染病78%与野生动物有关，或者说来源于野生动物。因此应尽量少养，更不要吃。”
目前，冠状病毒由动物到人、人与人的主要传播方式是接触传播和飞沫传播。（包括手污染导致的自我接种）以及不同大小的呼吸道气溶胶近距离传播。前期各医院收治病例多数有武汉市华南海鲜市场暴露史，部分病例为家庭聚集性发病，医务人员感染风险高。从现在定义的急性呼吸道传染病推断，近距离飞沫传播应该是主要途径。
2002年，SARS病毒在我国南部的野生动植物市场上出现，导致患者呈现发烧，发冷，头痛和干咳等典型流感症状，继而发展成致命的肺炎，最终在32个国家留下8000多病例。大多数SARS患者能够自愈或治愈，病死率约10%。
我国SARS病毒起源研究结果表明：SARS病毒来自野生动物，而与家畜家禽和宠物无关。2013年11月1日《科技日报》报道，中科院武汉病毒研究所石正丽研究团队分离到一株与SARS病毒高度同源的SARS样冠状病毒（SARS-like CoV），进一步证实中华菊头蝠是SARS病毒的源头。研究成果在线发表于《自然》杂志。经过仔细研究，发现中国北方的果子狸身上并未携带类SARS的冠状病毒（SARS-CoV），只有广东地区，那年冬天的果子狸身上携带着这类病毒。这表明果子狸可能只是病毒的一个中间宿主，它可能是被中华菊头蝠感染，从后者身上得到了这种病毒。2014年2月，徐德忠等发表于《医学争鸣》上论文指出，中华菊头蝠为非典样病毒（SARS-like-CoV）而非非典病毒（SARS-CoV）的贮存宿主，即中华菊头蝠为SARS样冠状病毒（SARS-like-CoV）的贮存宿主。
中东呼吸综合征（MERS）是2012年9月发现的一种由新型冠状病毒引起的急性呼吸道疾病。2013年5月23日世界卫生组织将这种疾病命名为“中东呼吸综合征”。该病毒首现于沙特，继而在中东其他国家及欧洲等地区蔓延。该病主要临床表现为：发热、咳嗽、呼吸急促和呼吸困难等急性重症呼吸道感染症状，部分病例会出现肾功能衰竭。MERS的致死率要比SARS高得多，达到了30%-40%，远高于SARS的10%。不过值得庆幸的是，它的传染力要比SARS弱得多，只有密切接触才会发生传染。
资料显示，目前中东呼吸综合征冠状病毒的传染源和传播途径尚不完全明确。在中东地区的病例接触骆驼等动物传染源而感染的可能性大。
传染病的传播与流行需3环节
传染病是由各種病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。
传染病的特点是有病原体，传染性和流行性，感染后常有免疫性。有些传染病还有季节性或地方性。
传染病的分类尚未统一，可以按病原体分类，也可以按传播途径分类。传染病的预防应采取以切断主要传播环节为主导的综合措施。传染病的传播和流行必须具备3个环节，即传染源（能排出病原体的人或动物）、传播途径（病原体传染他人的途径）及易感人群（对该种传染病无免疫力者）。若能完全切断其中的一个环节，即可防止该种传染病的发生和流行。各种传染病的薄弱环节各不相同。除主导环节外对其他环节也应采取措施，这样才能更好地预防各种传染病。
新型冠状病毒的起源
冠状病毒是一大类病毒，已知会引起疾病。患者表现从普通感冒到重症肺部感染不同，例如中东呼吸综合症（MERS）和严重急性呼吸综合症（SARS）。
人体内的冠状病毒最早于上世纪60年代在英国被分离出来，病毒因其表面皇冠状的突起物而得名。它可能与人、猪、猫、狗、鼠和鸡的呼吸系统感染相关。2003年中国出现的SARS病毒就属于冠状病毒。MERS为第六种已知的人类冠状病毒，也是过去10年里被分离出来的第三种。
此次引起流行的冠状病毒为一种变异的新型冠状病毒。由于冠状病毒发生抗原性变异产生了新型冠状病毒，人群缺少对变异病毒株的免疫力，所以可引起新型冠状病毒肺炎的流行。
冠状病毒大部分感染动物。很多野生动物都可能携带病原体，成为某些传染病的传播媒介。果子狸、蝙蝠、竹鼠、獾等是冠状病毒的常见宿主。
1月26日，中国疾控中心病毒病所在病毒溯源研究中取得阶段性进展。该所首次从武汉华南海鲜市场的585份环境样本中，检测到33份样品含有新型冠状病毒核酸，并成功在阳性环境标本中分离病毒，提示该病毒来源于华南海鲜市场销售的野生动物 。
2月9日，湖北省召开发布会，疫情防控科研攻关组专家陈焕春介绍了工作进展：“华南农业大学报道了穿山甲有可能是潜在的中间宿主，我们认为新型冠状病毒也可能存在多个中间宿主。该报道发现穿山甲毒株与目前感染人毒株序列相似度高达99%。这个相似性还在观察，它可能是某个基因片断，或整个全基因组序列。中国科学院武汉病毒所石正丽教授最近发现了新型冠状病毒与一种蝙蝠的全基因序列的同源性达到96%，如果（新型冠状病毒全基因序列）与穿山甲相似性高达99%，参考价值就更大了。当今人类新发传染病78%与野生动物有关，或者说来源于野生动物。因此应尽量少养，更不要吃。”
目前，冠状病毒由动物到人、人与人的主要传播方式是接触传播和飞沫传播。（包括手污染导致的自我接种）以及不同大小的呼吸道气溶胶近距离传播。前期各医院收治病例多数有武汉市华南海鲜市场暴露史，部分病例为家庭聚集性发病，医务人员感染风险高。从现在定义的急性呼吸道传染病推断，近距离飞沫传播应该是主要途径。
过往重要传染病毒起源
2002年，SARS病毒在我国南部的野生动植物市场上出现，导致患者呈现发烧，发冷，头痛和干咳等典型流感症状，继而发展成致命的肺炎，最终在32个国家留下8000多病例。大多数SARS患者能够自愈或治愈，病死率约10%。
我国SARS病毒起源研究结果表明：SARS病毒来自野生动物，而与家畜家禽和宠物无关。2013年11月1日《科技日报》报道，中科院武汉病毒研究所石正丽研究团队分离到一株与SARS病毒高度同源的SARS样冠状病毒（SARS-like CoV），进一步证实中华菊头蝠是SARS病毒的源头。研究成果在线发表于《自然》杂志。经过仔细研究，发现中国北方的果子狸身上并未携带类SARS的冠状病毒（SARS-CoV），只有广东地区，那年冬天的果子狸身上携带着这类病毒。这表明果子狸可能只是病毒的一个中间宿主，它可能是被中华菊头蝠感染，从后者身上得到了这种病毒。2014年2月，徐德忠等发表于《医学争鸣》上论文指出，中华菊头蝠为非典样病毒（SARS-like-CoV）而非非典病毒（SARS-CoV）的贮存宿主，即中华菊头蝠为SARS样冠状病毒（SARS-like-CoV）的贮存宿主。
中东呼吸综合征（MERS）是2012年9月发现的一种由新型冠状病毒引起的急性呼吸道疾病。2013年5月23日世界卫生组织将这种疾病命名为“中东呼吸综合征”。该病毒首现于沙特，继而在中东其他国家及欧洲等地区蔓延。该病主要临床表现为：发热、咳嗽、呼吸急促和呼吸困难等急性重症呼吸道感染症状，部分病例会出现肾功能衰竭。MERS的致死率要比SARS高得多，达到了30%-40%，远高于SARS的10%。不过值得庆幸的是，它的传染力要比SARS弱得多，只有密切接触才会发生传染。
资料显示，目前中东呼吸综合征冠状病毒的传染源和传播途径尚不完全明确。在中东地区的病例接触骆驼等动物传染源而感染的可能性大。