16S核糖体RNA基因和RNA聚合酶β亚基基因及基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱鉴定海洋副溶血性弧菌及其同源性分析的研究

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目的

评价16S核糖体RNA基因(16S rRNA)、RNA聚合酶β亚基基因(rpoB)及基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对海洋副溶血性弧菌的鉴定及同源性分析的性能。

方法

将50株海洋副溶血性弧菌以及与其亲缘关系相近的30株海洋溶藻弧菌、8株海洋坎贝式弧菌、11株海洋哈维氏弧菌、3株海洋需钠弧菌、2株海洋创伤弧菌分别用16S rRNArpoB和MALDI-TOF MS技术3种方法进行鉴定并做系统进化树、聚类分析,比较分析结果。

结果

50株海洋副溶血性弧菌用16S rRNA鉴定出5株,rpoB鉴定出41株,MALDI-TOF MS技术鉴定出41株。16S rRNA系统进化树的结果不能将海洋副溶血性弧菌和海洋溶藻弧菌、海洋坎贝式弧菌、海洋需钠弧菌、海洋创伤弧菌分开。rpoB和MALDI-TOF MS可以准确地做出同源性分析。rpoB鉴别来自不同地域的海洋副溶血性弧菌的能力优于MALDI-TOF MS,而MALDI-TOF MS在海洋副溶血性弧菌的环境株和临床株的鉴别上优于rpoB

结论

rpoB和MALDI-TOF MS技术鉴定海洋副溶血性弧菌准确,二者相结合是进行海洋副溶血性弧菌鉴定和同源性分析的适宜技术。

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