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以RAPD分子标记技术分析了3个不同盐度梯度下碱菀的遗传多样性与遗传分化，结果表明12个引物共扩增出165个可重复的位点，其中多态位点有145个，总多态位点百分率为87．88％，以中等盐度（P2）种群最高，高盐度（P1）种群次之，低盐度（P3）种群最低。AMOVA分子变异显示，83．56％变异来源于种群内，16．44％变异来源于种群间。种群间的遗传分化系数（Gst）为0．1488，种群间基因流（Nm）为2．8602。