【摘 要】
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新一代测序技术已经广泛应用于转录组的研究(即RNA-seq),其数据几乎涵盖了特定组织和特定时期的所有转录本。由于其高通量和低成本的优势,RNA-seq越来越受到研究者的青睐,特
【机 构】
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浙江省农业科学院; 江西省农业科学院;
【基金项目】
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国家自然科学基金(批准号:31201648);中国博士后科学基金(批准号:2012M521203);浙江省博士后科研项目择优资助(批准号:Bsh1201032);浙江省花卉新品种选育协作组项目(批准号:2012C12909-10);浙江省创新团队(批准号:2009R50034)资助的课题~~
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新一代测序技术已经广泛应用于转录组的研究(即RNA-seq),其数据几乎涵盖了特定组织和特定时期的所有转录本。由于其高通量和低成本的优势,RNA-seq越来越受到研究者的青睐,特别是在那些缺乏基因组信息的物种上。在此综述中,讨论了RNA-seq的测序策略,包括物种遗传背景的考量,测序平台和数据拼接软件的选择。RNA-seq数据对于SSR和SNP等分子标记的开发是非常有用的,由于这些标记在相关物种中有很高的通用性,因此在比较作图中有其不可替代的优势。
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