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采用荧光原位杂交法分析了贵州阿哈湖深层水环境中总微生物、真细菌和硫酸盐还原菌数量.结果表明:该湖水中微生物总量为1.6×107个·L-1,真细菌占微生物总量的52.9%,且微生物总量和真细菌数量垂直变化无明显差异.随着水体深度的增加,活性微生物数量增加,且微生物的群落结构更加复杂.阿哈湖深层水体中有一定数量的硫酸盐还原菌存在.