非小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析

来源 :西安交通大学学报:医学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:baoyuan000
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目的应用生物信息学方法分析非小细胞肺癌(NSCLC)基因芯片数据,筛选差异表达基因(DEGs),探讨与NSCLC预后相关的生物标志物,为NSCLC的治疗提供新靶点。方法在GEO数据库下载NSCLC相关的基因芯片数据,运用GEO2R工具和FunRich3.1.3软件筛选出两个数据集共同的DEGs。应用DAVID数据库对DEGs进行GO分析及KEGG分析,并通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,分析筛选出前20个枢纽基因。运用Kaplan-Meie
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目的利用网络药理学和分子对接技术研究白屈菜红碱抗乳腺癌的作用机制。方法通过Swiss Target Pretion数据库预测白屈菜红碱作用的靶点集,Mala Cards数据库收集乳腺癌的相关靶点集,取疾病与药物的靶点交集作为白屈菜红碱抗乳腺癌的潜在作用靶点;应用STRING数据库构建靶点蛋白相互作用网络(PPI),并进行拓扑网络分析得到白屈菜红碱抗乳腺癌的核心靶基因;通过Metascape数据库进行基因本体论功能(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG)富集分析;使用Kaplan-Meier Pl
目的探讨神经内镜下改良后颅窝减压术治疗Chiari畸形Ⅰ型的临床疗效。方法回顾性分析2015年1月至2019年12月西安交通大学第一附属医院神经外科收治的63例Chiari畸形Ⅰ型患者的临床资料。其中,28例行神经内镜下改良后颅窝减压术(观察组),35例行后颅窝减压硬膜成形术(对照组)。对比两组术后Tator分级、脊髓空洞改善及并发症的发生,评估术后疗效。结果63例患者手术顺利,无死亡等严重并发症。其中,观察组术后有效率为78.6%,对照组为54.3%,差异有统计学意义(P<0.05);观察组术后脊
目的回顾性分析2015年7月-2020年10月间接受艾拉莫德(iguratimod,IGU)治疗至少6个月,有3次以上随访记录的类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者的人群特征、疗效及影响因素。方法本研究纳入105例RA患者,所有患者均连续接受IGU治疗至少6个月,随访3次。观察治疗前后的临床表现、红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)、疾病活动指数(DAS28)评分、类风湿因子(RF)、抗环瓜氨酸肽(ACPA)、免疫球蛋白(IgG、IgA和IgM)、淋巴细胞亚群,同时观
目的对比分析胸腔镜经剑突下与经肋间胸腺瘤切除术的临床疗效和安全性。方法纳入2015年1月至2019年3月于西安交通大学第一附属医院胸外科连续所行胸腔镜下胸腺瘤切除术患者124例,分为剑突下组47例,肋间组77例,对比分析两组临床特征及手术指标,术后疼痛评分、主要并发症情况和生活质量等。结果手术时间、术中出血量、术后肺炎、心律失常、膈神经麻痹、肌无力危象发生率两组间差异无统计学意义(P>0.05)。平均住院日:剑突下组低于肋间组(P<0.05)。疼痛评分:剑突下组术后第1天、第3天NRS伤口疼痛
目的比较5种常用的变量筛选方法在高维生物医学数据变量筛选中的实际效果,探讨样本量和变量间关联性对变量筛选效果的影响,为制定高维生物医学数据分析中的变量筛选策略提供依据。方法基于R语言实现变量筛选算法,通过Monte Carlo算法模拟产生不同条件下的高维数据,用于评估和比较不同方法在特定数据条件下的变量筛选效果。以筛选结果的真阳性率、真阴性率作为变量筛选效果的评价指标。结果在设定的高维数据情况下,样本量增加时,各变量筛选方法的筛选效果均变好,变量间的关联性对变量筛选的效果也有影响。模拟结果显示,5种方法中
Chiari畸形又称小脑扁桃体下疝畸形,是小脑扁桃体向下延伸,经枕骨大孔突入颈椎管的一种先天性发育异常,是一种常见的颅颈交界区畸形。其发病机制复杂,多伴有合并症及并发症,临床表现特异性差,而最富有争议的是治疗方案及手术方式的选择。基于近年来的研究进展和新认识,本文综述了Chiari畸形的分型、发病机制、诊断和治疗等,以期对以后的基础与临床研究提供参考与帮助。
目的分析4例吡哆醇依赖性癫痫(pyridoxine-dependent epilepsy,PDE)患儿的临床特征及分子生物学特征,为早期识别PDE提供临床依据。方法选取2016年1月至2019年6月于西安交通大学第二附属医院儿科神经组住院部治疗的4例PDE患儿的临床资料及血液生化、脑电图、头颅磁共振成像(MRI)等结果,抽取患儿及患儿父母的外周静脉血,从白细胞中提取基因组DNA,通过设计引物,使用PCR技术扩增5号染色体长臂上的致病基因乙醛脱氢酶7家庭成员A1(aldehyde dehydrogenase
目的了解海洛因依赖肺结核感染者合并丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染状况及影响因素,为防治措施的制定提供科学依据。方法收集西安市第八医院219例海洛因依赖肺结核感染者的人口社会学特征、吸毒史并进行血清学检测,通过χ2检验及多因素Logistic回归方法分析HCV感染的危险因素。结果海洛因依赖人群肺结核合并HCV感染率为71.2%,高于合并HBV(10.9%)、HIV(5.9%)感染率,其中海洛因静脉注射者肺结核合并HCV感染率为92.9%。感染的危险因素为静脉注射(OR=18.
目的观察多靶点酪氨酸激酶抑制剂阿西替尼(Axitinib,AG-013736)对肝纤维化的治疗作用。方法用四氯化碳(carbon tetrachloride,CCL4)腹腔注射以诱导建立小鼠肝纤维化实验模型,于造模2周、4周时分别给予阿西替尼-羧甲基纤维素(CMC)溶液及CMC溶液灌胃处理,治疗1周、2周后处死小鼠,并取肝脏组织标本进行HE染色、Masson染色及α-SMA免疫组化检测;体外实验以不同浓度的阿西替尼CMC溶液分别干预人肝星状细胞系(LX2)及人正常肝细胞系(LO2),于48、72 h进行M
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