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为应用ISSR分子标记对黄皮种质资源、分子标记辅助选择育种及其遗传多样性研究，通过单因素和正交试验对ISSR—PCR反应体系进行优化。结果表明，采用改良SDS法提取的DNA条带完整、无RNA污染，适于ISSR-PCR扩增；黄皮ISSR分析最适的扩增体系是：20μl的反应体系中含30ng的模板DNA、1．5UTaqDNA聚合酶、0．4μmol／L引物、0．3mmol／L dNTPs以及引物（gA）8C的最佳退火温度为52．4℃。