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医院信息系统（Hospital Information System，以下简称HIS）系统对医院的现代化管理提供了支持，但由于认识上的不足或偏见，在系统建设的过程中存在一些问题，严重影响了HIS的质量，主要表现为：医院对系统建设缺乏整体性长远规划；依照传统管理思想和工作流程对软件无限制客户化，导致程序不稳定；专业人才的知识结构和专业特质不显著；后期维护资金投入不足，影响信息资源利用；信息部门职能权威不够，难以积极发挥作用。