目的探讨细菌耐药机制指导在促进抗生素合理用药中的应用价值。方法选取长春市一汽总医院2016年2月—2018年1月收治的接受抗生素治疗患者240例,依照硬币法分为对照组与试验组,每组120例。对照组给予常规用药指导,试验组在对照组基础上给予细菌耐药机制指导。比较两组患者医院感染管理质量指标情况及临床医师对抗生素合理应用知识的掌握度。结果试验组医院感染率、多重耐药菌检出率、联合用药率、抗生素不合理用药率、高耐药性药物使用率低于对照组(P<0.05)。试验组指导药师耐药机制、药物轮替制度、病原学诊断指导意义、耐药性药物及划分、药物动力学检测指导意义评分高于对照组(P<0.05)。结论细菌耐药机制指导可有效提高医院感染管理质量,增强临床医师对抗生素合理应用知识的掌握度,促进临床抗生素合理应用。