【摘 要】
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用打分矩阵的五种算法,从蛋白质的氨基酸序列出发,以氨基酸为参数,分别对3088个同源性小于40%的蛋白质和2878个同源性小于33%的蛋白质的β-发夹模体片断进行了识别。利用self—con
【机 构】
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内蒙古工业大学理学院,沈阳工业大学辽阳校区基础部
【基金项目】
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内蒙古自然科学基金资助项目200508010509
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用打分矩阵的五种算法,从蛋白质的氨基酸序列出发,以氨基酸为参数,分别对3088个同源性小于40%的蛋白质和2878个同源性小于33%的蛋白质的β-发夹模体片断进行了识别。利用self—consistency和10—fold cross—validation两种方法对五种算法进行检验,结果表明,Claverie(1996)算法相对较好,对3088个蛋白质的平均识别精度达到了77.7%和76.1%。
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