【摘 要】
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为研究WRKY转录因子在小麦胚性愈伤组织形成中的功能,以小麦基因组信息和愈伤组织形成发育过程中的转录组数据为基础,利用生物信息学方法,在全基因组范围内进行小麦WRKY转录因子的鉴定,并对小麦胚性愈伤组织形成过程中TaWRKY基因的表达模式进行分析.结果表明,在全基因组范围内共鉴定到270个小麦WRKY转录因子(TaWRKY01~TaWRKY270),根据WRKY保守结构域数量和锌指结构域类型可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三组,分别包含41、145和84个.在愈伤组织转录组文库中,鉴定到39个TaWRKY基因,其中27个
【机 构】
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信阳农林学院,河南信阳464006;信阳农林学院,河南信阳464006;南京农业大学农学院,江苏南京210095
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为研究WRKY转录因子在小麦胚性愈伤组织形成中的功能,以小麦基因组信息和愈伤组织形成发育过程中的转录组数据为基础,利用生物信息学方法,在全基因组范围内进行小麦WRKY转录因子的鉴定,并对小麦胚性愈伤组织形成过程中TaWRKY基因的表达模式进行分析.结果表明,在全基因组范围内共鉴定到270个小麦WRKY转录因子(TaWRKY01~TaWRKY270),根据WRKY保守结构域数量和锌指结构域类型可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三组,分别包含41、145和84个.在愈伤组织转录组文库中,鉴定到39个TaWRKY基因,其中27个与在全基因范围内鉴定到的TaWRKY基因相同,12个在小麦愈伤组织中特异表达.差异表达分析表明,11个TaWRKY基因差异表达,大部分在胚性愈伤组织培养3~15 d时下调表达,且在胚性愈伤组织中比同时期非胚性愈伤组织中表达量高,推测部分TaWRKY基因可能参与小麦胚性愈伤组织的形成.
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