本文主要关注政府补贴及知识产权保护对于企业R&D投资的激励效应以及两者对企业R&D投资的协同影响。关于政府补贴对企业R&D投资的影响,现有研究以实证的方法得出了促进作用、抑制作用,以及无显著激励效应等不同的结论,而企业R&D投资决策与企业所处的环境相关,实证研究中往往并未将环境因素加以考虑,因此,未能给出政府补贴产生各类激励效应的原因及条件。本文引入知识产权保护作为影响企业创新活动的环境因素,并分析在不同的环境因素下,企业R&D投资决策的制定过程以及政府补贴在环境因素作用下其激励效应产生的变化。首先,我们借鉴AJ模型对于企业研发投入决策的刻画,加入政府补贴的因素,通过企业间的博弈过程分别求解对于获补贴企业与未获补贴企业的最优决策,通过模型分析我们得出两种不同的决策过程,并根据不同的决策方式的特点将企业划分为两种类型:高技术产业及传统产业。我们发现两类产业的企业在不同环境,即不同知识产权保护强度下,R&D投资对政府补贴有不同的反应。模型对于现有研究中存在的不同激励效应给出一个理论上的解释。作为推论,模型也揭示了不同的补贴方式也可能产生不同的激励效应。其次,根据模型的推论及相关理论分析,我们通过近年来A股上市公司的非平衡面板数据进行检验。从数据回归结果来看,实证模型支持了本文博弈模型所推导的结论。知识产权保护的加强对于传统产业及高技术产业的企业R&D投资均有促进作用。而政府补贴对企业R&D投资的作用则受知识产权保护水平的影响:对于传统产业,在知识产权保护较弱时,政府补贴将产生部分负面影响,并在一定程度上抵消了其对企业R&D投资的促进作用,而在知识产权保护水平较强时,政府补贴将促进企业R&D投资,同时,政府补贴与知识产权保护对企业R&D投资有显著为正的协同效应;对于高技术产业,无论知识产权保护水平高低,政府补贴均促进企业R&D投资,但政府补贴与知识产权保护的协同效应不显著。实证结果确认了政府补贴的激励效应受来自于企业或产业特征及知识产权制度等因素的影响,也印证了博弈模型的结论。最后,根据本文理论与实证模型的相结合所得结果,我们提出了政府制定补贴政策及知识产权保护制度时的相关建议。