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癫痫部分性发作源于中枢神经系统的某限定区域。许多病因都能导致痫灶的产生。新皮质区的致痫灶通常是因发育改变、肿瘤及其它畸变、脑外伤引起，少数情况下为基因异常引起，而成年后开始的癫痫发作也可能是中风后大脑皮质改变的结果。癫痫部分性发作最常见的形式是始自颞叶内侧结构如杏仁、内嗅皮质和海马，通常以不同程度的海马神经元丢失为特征。当海马的门区，CA1和CA3区细胞丢失少于50％时，颞叶内侧癫痫（mesial temopral lobe epilepsy，MTLE）归类于非海马硬化；而当这些区域细胞丢失大于50％时则