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芥子酶在植物细胞中有可溶性的自由二聚体和不溶的结合形式两种存在形态。本研究发现物种间芥子酶的形态有较大差异。番木瓜芥子酶在种子、子叶和真叶等3种组织中，主要以可溶形式存在，不溶态芥子酶微量。而在油菜种子中，芥子酶主要以结合形式存在，在子叶和真叶中，芥子酶则主要以可溶形式存在。萝卜的芥子酶介于二者之间。供试3个物种的可溶性和不溶性芥子酶都存在相互抑制的现象。