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从南洞暗河系统生态环境地质现状特征人手,根据暗河系统水文地质条件、水文地球化学特征和由人类活动带来的对地下水环境影响的不同。以地表水和地下水的转化、自净能力及含水层环境容量等为依据,并综合考虑区内工农业布局、社会经济发展规划等多种因素,从科学管理的角度,将南洞暗河系统划分为三级水资源管理保护区,使暗河水资源管理更科学合理,真正做到“在保护中开发,在开发中保护”,充分发挥其应有的社会、经济和环境效益。