韩剧《大长今》曲终，与起初的狂热赞美不同，观众也冷静地挑剔起来。韩剧的通病——情节拖沓在《大长今》也有，好多剧情经不起推敲，衔接不缜密……有人就罗列了以下一些《大长今》的“毛病”。
　　
　　剧情不合理
　　
　　之一：长今的大意
　　长今一直都把母亲留下的小册子当作宝，总是随身携带。但某晚看完账簿时，竟疏忽地夹到账簿里，显然是给下面的“被盗”做准备。
　　之二：50岁生孩子
　　剧中涉及好几位女人生孩子。先是皇后小产，之后也没什么交代，最后身边竟冒出一个七八岁的儿子“庆源大君”来。还有为检验硫磺鸭子是否有毒，姜德久逼老婆吃了好几个月的鸭子，结果还怀孕了，但剧中孩子是怎么不见的，只有两年后的一句交代。还有最后长今的女儿，按推算是50岁才生下的，太不可思议了。
　　之三：长今父亲生死不明
　　长今的父亲被抓走，直至70集演完后，是死是活都没有交代。
　　之四：演员模式化表情
　　剧中每个演员都有自己一套模式化的表情，譬如长今每次受到污蔑时，就说不出话，嘴角颤动，眼神焦急，“我，我，娘娘，不是，我……”的不停；同样，演员们说话的语气在各种场合也出奇的相同。包括最后长今、闵政浩和女儿8年后再度回到宫廷，各个人物一点不显老，和原来没有丝毫差异。
　　
　　镜头穿帮
　　
　　可笑穿帮镜头：医女穿高跟鞋
　　在第49集中，医女信非到书库找书，脚上竟穿着时下流行的高跟鞋，这应该是《大长今》穿帮镜头中最让人捧腹的了。看来医女们也得顾及形象，太矮了上镜不好看。
　　在主打美食的《大长今》中，因为演员不可能都是做菜行家，所以像拍快速切菜等高难度动作时，宫女们的纤纤玉手都不见了，取而代之的则是一双双又红又肿的胖手。
　　常识穿帮镜头：不锈钢餐具
　　一大桌子菜呈给皇上，都是用闪闪发亮的不锈钢餐具来装的，这是最不应该犯的常识性错误。
　　荒谬穿帮镜头：创可贴
　　长今给病危的皇后娘娘的保姆尚宫今夏米看病时，她的左手手指上竟贴着创可贴，实在太马虎了。
　　精细穿帮镜头：长今的女儿
　　要找出这个穿帮镜头，肯定得有好记性。在第6集比赛穿松子时，在长今跟连生中间的那个小宫女，也就是第一排从左边数第2个、从右边数第4个，后来却成了长今和闵政浩的女儿。
　　疏忽穿帮镜头：热汤中油凝固
　　在最高尚宫比赛角逐时，今英煮牛骨汤时，一边扇火，汤上还冒着热气，一边还可以把凝固的牛油捞出来。众所周知油遇热就会融化，而且她还煮了好长时间。
　　
　　历史错误
　　
　　错误一：呈上满汉全席
　　长今所处的历史时期是我国的明朝，剧中崔尚宫却给使节呈上满汉全席，还不止一次说道：“我们就准备满汉全席吧，吃了几天清淡的食物，一定会很喜欢美味的满汉全席。”满汉全席是清朝为团结满汉关系创立的。
　　错误二：明朝使者穿黄袍
　　明太祖时就规定，一切黄色都是御用色，皇族以外的任何人，在任何场合、任何东西上都不能使用。但是剧中明朝使者居然身穿黄色官服，要让皇帝看见了肯定得株连九族。
　　错误三：丁未年考上医女
　　长今考医女在宫廷门口看发榜这场戏中，有个特写镜头让我们可以看清楚旁边的年月日：丁未年二月十二日。朝鲜古代所使用的干支纪年和中国是完全一样的，即每60年一个甲子，和长今最近的丁未年分别是1487年和1547年。而根据记载，朝鲜中宗的生卒时间是1488年3月5日至1544年11月15日，刚好在两个丁未年之间。换句话说，长今绝不可能在丁未年考上医女。