基因集分析方法统计理论探讨

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【提要】目的从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架。方法采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质。结果自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858。而竞争性原假设方法曲线下面积AUC为0.512。相同设定条件下,bootstrap方法的错误发现率(最高为0.015)低于permutation检验(最高为0.075);而permutation方法的检验效能(0.89)优于bootstrap法(0.67)。结论有效的基因集分析
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