【摘 要】
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目的 建立寡核苷酸基因芯片检测HBV基因分型的方法并对HBV携带者基因型进行临床分析.方法 根据Genbank中已发表的128株HBV全基因组序列系统进化分析结果设计了A～H不同HBV基因
【机 构】
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中国科学院上海微系统与信息技术研究所
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目的 建立寡核苷酸基因芯片检测HBV基因分型的方法并对HBV携带者基因型进行临床分析.方法 根据Genbank中已发表的128株HBV全基因组序列系统进化分析结果设计了A～H不同HBV基因型的特异探针及巢式PCR引物.利用反向杂交原理,先将不同HBV基因型特异的寡核苷酸探针固定在芯片上,再与地高辛(Dig)标记的扩增产物杂交从而检测HBV基因型.本研究检测了200例HBV DNA阳性患者,为了验证基因芯片检测的结果,随机选取其中40份样本进行直接测序.结果 在200份血清样本中检测到B、C基因型以及BC混合型,依次占11.5%(23/200),80.5%(161/200),8%(16/200).在与测序方法进行对比的40份样本中,除3份例混合型用测序方法不能检出混合感染外,利用测序结果进行系统发育分析得到的结果与基因芯片检测结果一致.进一步的克隆分析发现这3份样本均为混合感染.结论 基因芯片是进行HBV基因分型的方便可靠的工具,并能更好地检测不同基因型混合感染的情况.本研究中,HBV基因型以C型为主,与B型相比,C型HBV感染者病情较为严重.
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