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本研究采用PCR及序列测定的方法,对我国淡水铜绿微囊藻有毒株(M8641)和另一低毒的种类惠氏微囊藻(M574)rDNA 16S3S基因间隔区进行了序列的测定和分析,结果表明:rDNA 16S-23S基因间隔区可以作为一个精细且稳定的指标,用于微囊藻的分类和鉴定.并从分子水平提出了铜绿微囊藻与惠氏微囊藻在种系发生上有较近缘的关系.本文首次对微囊藻属Microcystis rDNA基因间隔区全序列作了报道,为微囊藻属的鉴定及系统学研究提供了分子基础.