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借助RAPD及ISSR分子标记对长筒石蒜的种质资源进行了初步的研究，结果表明：RAPD扩增得到的77个位点中，53个位点具有多态性，约占总数的68．8％；ISSR扩增得到的67个位点中，其中62个位点具有多态性，约占总数的92．5％。因此，长筒石蒜遗传多样性是十分丰富的，可以作为育种材料储备种质资源。从UPGMA聚类图来看，依据花色区分的3种类型，被聚在一起，表明亲缘关系较近。因此，在未来的长筒石蒜种质资源利用中，不同花色的长筒石蒜可以作为品系进行开发。