【摘 要】
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以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析.共鉴定得到15个成员,
【机 构】
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中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带生物技术重点开放实验室,海口571101南京农业大学园艺学院,南京210095;中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带生物技术重点开放实验室,
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以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析.共鉴定得到15个成员,将其命名为MaNPR1～MaNPR15.理化性质、保守功能结构域、重要的氨基酸残基及motif分析结果与其他物种所报道的有较高的一致度.香蕉NPR1基因家族成员种内进化树、基因结构及结构域的分类情况呈现出高度一致,表明了香蕉NPR1基因家族成员间有着明确的分工.种间进化树显示香蕉的NPR1基因分为3个分组,每个分组都含有拟南芥NPR1成员.主栽品种巴西蕉(Musa acuminata Colla.AAA group‘ Brazilian’)易感香蕉枯萎病,从巴西蕉CK及巴西蕉受枯萎病侵染2d的根系转录组数据中综合表达量及表达趋势选定8个成员,并在巴西蕉与抗(耐)Foc TR4品种GCTCV-119中验证其表达模式.基因MaNPR4及MaNPR11在抗感品种中表现出明显的差异表达,在抗病品种GCTCV-119中随着Foc TR4侵染时间延长表达量不断增加,而在感病品种巴西蕉中表达量呈下降趋势.表明MaNPR4及MaNPR11参与香蕉抗枯萎病过程.本研究结果为进一步利用香蕉NPR1基因进行香蕉抗枯萎病遗传改良奠定基础.
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