【摘 要】
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目的探讨miR-1254对结肠癌发生发展的影响及其在结肠癌中调控的差异表达基因(DEG)和信号通路。方法在人结肠癌细胞系SW1116中瞬转miR-1254模拟体,通过高通量RNA测序分析(RNA-
【机 构】
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北华大学医学院病原生物学教研室,上海交通大学医学院附属同仁医院内窥镜室
【基金项目】
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上海市卫计委面上项目(201440426),上海市卫计委青年课题(20154Y0160),上海市卫计委青年课题(20174Y0084)
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目的探讨miR-1254对结肠癌发生发展的影响及其在结肠癌中调控的差异表达基因(DEG)和信号通路。方法在人结肠癌细胞系SW1116中瞬转miR-1254模拟体,通过高通量RNA测序分析(RNA-seq),筛选出受miR-1254调控的DEG,由生物信息学分析这些DEG所涉及的信号通路和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。结果通过RNA-seq,筛选出了217条DEG。其中,121条下调基因,96条上调基因。这些基因主要富集在p53信号通路、氨酰-tRNA生物合成和内吞、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢以及N-聚
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