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目的 对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM/A363/09进行全基因组测序和分析,了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Geneious和Mega5.1软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析,应用RDP3和SimPlot3.5.1重组软件对序列进行重组分析。结果该分离株全基因组核苷酸序列长度为7425 bp,编码2194个氨基酸。其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Bastianni的同源性分别为81.2%和95.8%;与其他Echo30型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81.2%~88.6%和95.8%~97.8%;进化分析发现KM/A363/09毒株属于中国Echo30分支中的一支。而且发现KM/A363/09株基因序列在非结构区可能存在重组事件。结论云南分离株KM/A363/09属于中国Echo30分支中的一支,而中国分离株已经发生一定的进化。