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知识体系的综合化、社会问题的综合化、个体认识的综合化是设置综合课程的理论基础和指导思想。综合课程的实质是课程结构的几个要素，即学科、学生和社会的整合，也就是采用不同的整合手段和形式，使各学科中被人为分裂的各部分知识之间形成有机的、符合知识本质的联系，最大限度地回复和再现知识整体的本来面目。整合是综合课程的价值取向和本质核心。