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对采自广东省海陵岛的4属5种鲷科鱼类36个个体的线粒体Cyt b基因进行PCR扩增及序列测定，并结合在GenBank下载的同源序列，共56条Cyt b基因序列进行系统发育分析。结果显示,鲷科4属5种鱼类的Cyt b基因序列的平均碱基含量分别为：T 30.3%、C 31.1%、A 23.4%、G 15.2%，A+T含量(53.7%)大于C+G含量(46.3%)，其中单一突变位点18个，变异位点244个，保守位点490个，简约信息位点226个；种间、种内平均遗传距离分别在0.109~0.208、0.001~0.048之间。应用邻接法构建的分子系统进化树显示5种鲷科鱼类共聚为两大类群(Taxon)，对应两种不同体色类型，即银灰体色的灰鳍棘鲷、黑棘鲷与平鲷聚为TaxonⅠ；红体色的黄牙鲷、二长棘鲷形成TaxonⅡ。