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首次对42个柱花草种质的ITS1序列进行了比较分析。结果表明:42个炭疽病敏感与抗病柱花草种质的ITS1序列长度变化范围为302~314bp,G+C含量的变化范围为44%~45%;在它们的ITS1序列中,有8个插入位点,13个缺失位点,68个变异位点;并在15个限制性酶切位点上也存在差异;种质间的遗传分化距离变异范围为0.006~0.053,平均值为0.021。呆用非加权成对平均数法(UPGMA)构建了聚类树系图,42个柱花草种质可分为两大类、15个小类。该结果较好地反映了这些种质的差异。