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食管癌的发生和演进涉及多种染色体异常的积累，是一复杂的过程，但迄今为止还未发现特征性的染色体改变。应用荧光原位杂交（M-FISH），比较基因组杂交（CGH）等分子细胞遗传学技术对食管癌染色体畸变研究已取得了很多成果，鉴于以上几种细胞遗传学方法在探讨肿瘤发病机制中的广泛应用，且其在方法学上具有一定的互补性，现就其在探讨食管癌的分子细胞遗传学改变做一综述。