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【目的】利用已选的15对核心引物对棉花品种进行纯度鉴定和指纹图谱构建,对核心引物的实用性进行验证。【方法】选取4份棉花样品材料,用15对核心引物中的10对进行纯度鉴定;利用15对核心引物对14份来源可查品种进行遗传多样性分析和品种鉴别。【结果】4份样品的理论纯度依次为95%、88.89%、100%和93.33%;选用14对核心引物成功构建了14份棉花的指纹图谱。14份材料间遗传相似系数变幅为0.423 5~0.952 9,平均值为0.777 6,聚类图在0.604 0处将所有品种分为陆地棉和海岛棉两大类。