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采用16S-23S rDNA间隔区段（IGS）PCR—RFLP与16S rRNA基因部分序列分析的方法对饭豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析．由16S-23S rDNA IGS PCR—RFLP分析可知，所有菌株在52％的相似性水平上聚在一起，形成了慢生型菌群与快生型菌群这两大菌群．群Ⅰ中，在79％相似性的水平上分为ⅠA与ⅠB两个分支．群Ⅱ中，在62％相似性的水平上分为ⅡA与ⅡB两个分支，分支ⅡA在72％的相似性水平上进一步分为ⅡA1、ⅡA2和ⅡA3三簇；分支ⅡB中的饭豆根瘤菌与标准菌株USDA205