ChemWindow化学软件常见分子结构绘制介绍

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  摘 要:本文介绍了实用化学专业绘图软件ChemWindow的主要功能、启动方式与界面,通过对具体分子式和方程式的绘制操作,介绍了ChemWindow在分子结构绘制编辑功能方面的常见基本操作方法,并补充了相关操作技巧。
  关键词:ChemWindow 分子结构式 绘制
  中图分类号:TP391.7 文献标识码:A 文章编号:1672-3791(2011)11(c)-0047-01
  
  1 ChemWindow的主要功能
  ChemWindow主要功能是绘出各种结构和形状的化学分子结构式及化学装置,其主要功能分为以下4个模块。
  (1)分子结构绘制:化学键绘制、环结构绘制、化学反应方程式绘制、化学反应机理表示、相应文字说明、电子云表示等功能。
  (2)化学实验装置图绘制:常见实验装置组装。
  (3)化工工艺流程图绘制:化工设备链接。
  (4)复杂分子结构通用模板应用。
  
  2 ChemWindow的启动与界面
  2.1 啟动
  Chemwindow的启动方式:开始→所有程序→Bio-Rad Laboatories→Chemwindow,或者直接从桌面上双击Chemwindow图标。
  2.2 界面
  ChemWindow的界面主要是由“工具栏”和“编辑窗口”组成。其中工具栏是由常见的化学分子结构:如化学键、化学分子轨道、环状结构等构成,主要分为键工具、轨道工具、环工具等。Chemwindow的基本界面如图1。
  
  3 ChemWindow的常见功能应用[2]
  ChemWindow中的操作绝大部分由鼠标完成。与Windows画笔类似,编辑前先用鼠标选中所需要的工具,然后再将鼠标移到编辑窗口内,当光标显示“+”时,便可在相应的位置上单击左键,进行绘制。
  下面将以间硝基苯甲酸的结构绘制及常见的酯化反应为例,介绍ChemWindow中常见的分子结构绘制的常规操作。
  3.1 化学分子式的绘制
  以间硝基苯甲酸结构式为例:
  ①选择图标,在编辑窗口内点击一下,便可出现苯环。
  ②选择单键图标,将鼠标移到苯环的一个碳的位置上,在该碳上显示黑色实心方点()时,单击鼠标左键,出现单键,显示。
  ③选择图标,将鼠标移至编辑窗口单键预编辑的一端碳上,显示黑色实心方点()时,单击鼠标左键,出现光标,直接输入COOH,显示。
  ④选择单键图标,将鼠标移到的间位碳上,显示黑色实心方点时,单击鼠标左键,显示。
  ⑤选择图标,将鼠标移至编辑窗口间位单键预编辑的一端碳上,显示黑色实心方点时,单击鼠标左键,出现光标,直接输入NO2。
  ⑥完成间硝基苯甲酸的结构编辑,显示。
  在上述对化学分子式简单的基本绘制的基础上,ChemWindow在绘制复杂分子结构式时,存在一些技巧[3]:(1)利用复制、水平或垂直翻转等操作可绘出对称协调的分子结构式图形;(2)对分子图形可进行组合,分块处埋,即可将许多物体结合成一个物体(Ctrl+G)进行处理,或将一个物体分解成许多部分(Ctrl+U);(3)对整体分于图形既可进行放大、缩小、旋转等操作,也能对局部进行精确微调。
  3.2 反应方程式的绘制
  在掌握分子结构基本编辑的基础之上,以乙酸与乙醇的酯化反应为例,介绍反应方程式的绘制操作。
  ①选择图标,将鼠标移至编辑窗口,单击左键,出现光标,直接输入分子式。
  ②选择图标,将鼠标移至编辑窗口后侧,单击左键。
  ③同①法,编辑。
  ④选择反应式工具中的图标,将鼠标移至编辑窗口后侧,单击左键;(可选择图标,单击左键,选定,对可逆符号进行长短设置)。
  ⑤选择图标,将鼠标移至编辑窗口上方,单击左键,出现光标,输入浓,其中的编辑方法同①。
  ⑥选择图标,将鼠标移至编辑窗口下方,单击左键。
  ⑦同①、②法,编辑
  。
  ⑧选中①~⑦编辑的内容,按住Ctrl+G,将①~⑦编辑的内容合为整体图片:
  
  ,该图片可以直接复制粘贴至Power Point的幻灯片中或者Microsoft Word文档中进行运用。
  在绘制化学反应方程式时,如果遇到反应式较长时,分子式、反应符号等各部分之间又要处于同一水平线上,可以采取一定的技巧[3],对其进行编辑:①用选择工具选取该反应式;②从Arrange下拉菜单中选择Align Object命令,出现一对话框,选水平排序。
  ChemWindow在化学分子式方面强大的绘制功能,与Power Point的幻灯片中或者Microsoft Word文档连用[4-5],可以为日常的教学与科研带来方便。
  
  参考文献
  [1] 李梦龙,王智猛,姜林,等.化学软件及其应用[M].北京:化学工业出版社,2004.
  [2] 石蔚云.化学绘图软件——ChemWindow的应用研究[J].安阳大学学报,2003,2:35.
  [3] 刘劲刚,吴宗仁,倪诗圣.介绍一个实用的化学软件——ChemWindow[J].大学化学,12(5):33.
  [4] 陈翔,王昌栋.Chemwindow化学结构式的编辑与文件格式转换[J].广东药学,2004,14(4):8.
  [5] 吕申壮.在WORD中添加输入“分子结构式”的工具[J].计算机与应用化学,2000,17(5):477.
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