肺腺癌差异基因的生物信息学研究

来源 :牡丹江医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lxfsb001

【摘要】

：

目的通过生物信息学筛选出肺腺癌中的差异基因,为肺腺癌分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据。方法从GEO数据库中选择编号为GSE118370及GSE116959的基因芯片,在TCGA数

【作者】

：

兰宏伟马微李娜赵若晗

【机构】

：

牡丹江医学院附属红旗医院肿瘤科,牡丹江医学院研究生处,牡丹江医学院附属红旗医院内分泌科,牡丹江医学院科研处

【出处】

：

牡丹江医学院学报

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

肺腺癌生物信息学差异基因 GEO TCGA Lung adenocarcinoma Bioinformatics differentially expres

【基金项目】

：

牡丹江医学院研究生创新科研项目(2019YJSCX-03MY),黑龙江省高等学校基本科研业务费科研项目(2019-KYYWFMY-0026),黑龙江省高等学校基本科研业务费科研项目(2019-KYYWFMY-0063),黑龙江省教育厅攀登计划项目(2018-KYYWFMY-0009)

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目的通过生物信息学筛选出肺腺癌中的差异基因,为肺腺癌分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据。方法从GEO数据库中选择编号为GSE118370及GSE116959的基因芯片,在TCGA数据库中选择肺腺癌的转录组数据,分别通过R语言下载、整理并筛选出差异表达基因(Differentially expressed genes,DEG)。通过在线工具STRING得到DEG的蛋白互作(Protein-protein interation,PPI)网络,利用Cytoscape软件得到枢纽基因(hub基因);Onco

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