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蛋白质是活细胞生物功能的主要载体。但单个蛋白质并不能发挥任何作用，只有与其他蛋白相互作用才能具有生物学功能。蛋白质相互作用在绝大多数细胞水平的生物过程，如DNA复制与转录、信号转导和细胞周期调控等中有着十分关键的作用。从系统水平上研究蛋白质相互作用，被认为是揭示细胞内部运行机制的一个重要的策略。