黄芪转录组基因模型预测

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目的:黄芪作为传统补气中药具有悠久历史,从黄芪中已经提取出多种有效成分。目前黄芪的基因组还未进行测序,因此基于转录组数据预测基因模型,将有助于黄芪在医药领域的广泛应用。方法:本文基于黄芪转录组数据以及已有的亲缘关系相近物种全基因组序列,对黄芪转录组的unigene在基因组中的情况进行预测分析。结果:预测结果表明,黄芪和大豆Glycine max、蒺藜苜蓿Medicago truncatula、百脉根Lotus japonicus 3种植物有较近的亲缘关系,和蒺藜苜蓿比对上的基因数目是2 039条,碱基相似度是90.14%;和大豆比对上的基因数是1 948条,碱基相似度是90.40%;和百脉根比对上的基因数是1 003条,碱基相似度是89.77%。结论:黄芪与3种植物比对上的基因在3种植物的各染色体上,以及染色体外基因组上均有分布。
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