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期刊论文
蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
来源 :浙江农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:new_fisher
【摘 要】
:
基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进
【作 者】
:
贾美多
杨闫
张盈盈
李春
【机 构】
:
渤海大学数理学院
【出 处】
:
浙江农业学报
【发表日期】
:
2014年6期
【关键词】
:
5-字母分类模型
30维向量
系统发生分析
5-letter classification
30-D vector
phylogenetic analysi
【基金项目】
:
辽宁省“百千万人才工程”项目(2012921060), 辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划(LJQ2011122)
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基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
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