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采用抑制差减杂交技术，构建了陆地棉抗病品种冀棉20经黄萎病菌诱导8h、12h、24h、48h后的混合SSH文库，文库共包含800个阳性克隆。对质粒的酶切和巢式PCR结果表明，插入片段大小平均为400bp。随机挑选20个阳性克隆进行测序，利用BLASTn和BLASTx进行序列相似性分析，发现20条EST都可以找到功能已知的同源序列，其中在BLASTn比较结果中，功能已知的有12条，占全部EST的609／5；BLASTx的比较结果中有14条功能已知，占全部EST的70％。这些同源序列涉及到10种与抗病防御相关