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缺硼使芝麻植株器官受到不同程度的损害。通过电子显微镜观察,叶片除表面变形,气孔关闭外,其内部结构也发生很大变化,叶脉小且维管束相对少,叶肉细胞排列紧密,同时叶绿体发育不全,叶绿体数量减少,因而影响光合作用的正常进行。叶柄和茎的维管束导管小且次生化程度低,细胞排列紊乱。此外芝麻叶的线粒体以及花粉粒等也受到了缺硼的影响。