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豆科植物的新鲜根瘤经表面灭菌，破碎后直接加入200μL4mol/L异硫氰酸胍（GUTC）裂解液混匀，离心去掉根瘤残留物，再加入适量RNA酶，37℃温育30min后，加入20μL硅藻土吸附液，室温处理15min离心去掉上清，沉淀经GUTC裂解液二次处理，再分别用洗涤液，室温处理15min离心去掉上清，沉淀经GUTC裂解液二次处理，再分别用洗涤液，70%酒精洗涤，最后，硅藻土沉淀经真空干燥，加入20μL超纯水洗涤硅藻土沉淀，即可获得类菌体根瘤菌DNA，所获得的DNA可以用于AFLP，16SrRNAPCR反应。