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证候研究是中医基础研究的一个关键的科学问题，中医的“证”是辨证论治的起点和核心。随着后基因组时代的到来，系统生物学逐渐受到关注。系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成，以及在特定条件下这些组分间相互关系的科学，将系统生物学应用于中医证候研究是目前的研究热点。本文探讨了中医证候与系统生物学的相关性及其意义，总结了基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学在中医证候研究中取得的成就，同时分析了系统生物学在中医证候研究中存在的问题与不足，并提出了今后研究的设想，为从多学科、多