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云南具有丰富的茶树资源,紫芽茶树是其中重要的一种.红芽直立茶具有典型的紫色芽叶,富含花青素,是重要的特异茶树种质资源.本研究通过转录组技术对红芽直立茶的不同叶色进行研究,筛选到8779个差异表达基因, GO和KEGG富集结果显示,差异基因涉及到多个色素形成及积累的功能.构建茶叶中类黄酮和类胡萝卜素生物合成两个途径,紫色叶中大量合成黄酮类化合物的关键基因上调,与茶叶紫色的形成密切相关.同时,紫色叶中类胡萝卜素的生物合成受到抑制,紫色叶具有更好的抗衰老能力.本研究将有助于对茶树紫色叶形成机制的认识,为特色茶育种研究奠定基础.