优惠原产地证书作为通关证明以及享受优惠关税的证明，进口国海关一般只要求提供正本。但笔者在多年从事产地证的签发过程中，经常遇到企业拿到证书之后，直接将正副本证书一起邮寄给客户，这既不合法，也可能造成后续工作的隐患。证书副本作用主要体现在以下三个方面：
　　
　　进口国退证核查
　　
　　一般来说，为确保优惠政策的准确实施，当进口方海关在怀疑原产地证书的真实性、产品原产资格或是否满足其他要求时，会通过信函等方式将原产地证书复印件或其它相应资料送交出口方签证机构，并说明核查理由。签证机构则可以要求出口商提供任何证据，并对其账目进行审查或其他适当的检查。然后尽快将核查结果告知提出核查请求的海关。该结果必须确认文件是否真实，相关产品是否可以视为原产产品并满足本章的其他要求，包括对事实的裁定，以及做出判定的法律依据。如果自核查请求提出之日起六个月内没有收到答复或答复结果未包含足够的信息以确定有关文件真实性或产品的真实原产地，提出核查请求的海关将拒绝给予优惠关税待遇。这是普惠制中行政合作的要求，也是区域性优惠贸易协定中原产地核查的要求。这些规定中，一般要求申请签发原产地证书的出口商应当对相应文件至少保存三年，例如：记录出口商或供应商获得有关货物过程的直接证据，如其账目或內部账册；用于证明所用原料原产资格的文件；用于证明原料生产和加工的文件：证明所用原料原产资格的原产地证书。这些文件，其用途在于证明原产地证书所涵括产品具有原产资格并满足其它要求，因此要与相应的证书副本一并保存。
　　
　　办理重发证书必须的证明
　　
　　根据中国一东盟自贸区原产地规则，在东盟各国，办理进口产品通关时，进口商应向海关当局提交原产地证书FORM E正本和第二副本。在FORM E证书被盗窃、丢失或损毁时，出口商可以书面形式向签证机构申请签发原产地证书正本和第二副本的重本证书。证书的第12栏应签署“CERTI FIED TRUECOPY”。重本证书应在原证书签发之日起一年内及出口商向签证机构提供原证书第三副本的情况下签发。
　　根据中国一巴基斯坦自由贸易区原产地规则，出口人应向进口人提供证书正本，以便呈交给进口口岸的海关当局。第一副本应由出口成员方签证机构留存。第二副本由出口人留存。如原产地证书被盗、遗失或损毁，出口人可以向原政府签证机构书面申请签发原证正本及第二副本的经证实的真实复制本，复制本可依据签证机构存档的有关出口文件签发，并在第13栏中注明“经证实的真实复制本”(CERTl FjED TRUE COPY)。原产地证书的经证实的真实复制本应在出口人向原签证机构提供了原证第二副本的情况下，并在其正本签发之日起一年之内方可补发。
　　当需要办理重本证书时，只有提供这些证书的相应副本，才可以办理重本证书。
　　
　　货物退运证明
　　
　　由于各种原因，目前国际贸易中普遍存在退货现象，退货在国内海关报关时，海关有时会要求出口商提供出口时签发的原产地证书。如果国外客户拒绝退回原产地证书正本，在此情况下，如果出口商保留有证书副本，则可以向检验检疫机构申请盖章，用以标注，此证书副本与签证机构留存副本一致，该副本可以作为退运货物的证明之一。
　　综上所述，为了避免不必要的麻烦，办理证书的申请人应注意保存相应的副本，以及其它进出口的相关资料，并按照要求保存三年。